晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密情报。 为了找出隐藏的对手，柯南和灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士（绪方贤一 配音）、服部平次（堀川亮 配音）以及远山和叶（宫村优子 配音）通力合作，与间谍展开连番斗智斗勇的较量……
七緒はるひ,折笠爱,横山智佐,菊池正美,小桜エツコ,小林优子
中村悠一,花泽香菜,生天目仁美,竹达彩奈,早见沙织,佐藤聪美,田村由香里
小林裕介,古川慎,市之濑加那,沼仓爱美,佐藤元,前野智昭,村瀬步,上田丽奈,高桥花林,河西健吾,麦人,中村悠一,石田彰,丰崎爱生
未知
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梶裕贵,村濑步
菊池正美,折笠爱,七绪春日,横山智佐,富泽美智惠,小林优子,进藤尚美,小樱悦子,森下由树子
梶裕贵,洲崎绫,小泽亚李,小野贤章,置鲇龙太郎,杉田智和,潘惠美,小清水亚美,小松未可子
悠木碧,本渡枫,千本木彩花,田中美海,原田彩枫,沼仓爱美,和气杏未,杉山里穗
已完结
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