位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约8成是学生的这座都市中，实施着超能力开发的特殊课程，学生们的能力被给予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。 高中生上条当麻，也是住在学园都市的学生之一。他由于隐藏在右手中的力量——只要是异能之力，就连神的加护都能消除的“幻想杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的“无能力”，过着充满不幸的人生。 而上条的学生生活，由于暑假开始时从天而降的纯白修女而发生了巨大的变化。自从与逃离“魔法”世界的她——“禁书目录茵蒂克丝”相遇开始，上条就被卷入了各种各样的事件中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝关联的“魔法”方，在惊险地解决双方事件的过程中，他的人际关系也逐步扩展。之后，魔法一方的十字教最大宗派罗马正教，终于注意到上条的存在……。 如同呼应魔法方一般，科学方的学园都市也有所动作。但也有与逐渐开始对立的世界动向抗争的人不断出现。那些通过与上条有所关联，而使命运大为改变的“英雄”们。 他们挺身而出与世界对峙。如同上条当麻做过的那样。 科学与魔法第三次交织之时，故事将大幅推进！！
杉田智和,堀江一真,小仓唯,长妻树里,富田美忧,清水彩香,海田朱音
七緒はるひ,折笠爱,横山智佐,菊池正美,小桜エツコ,小林优子
中村悠一,花泽香菜,生天目仁美,竹达彩奈,早见沙织,佐藤聪美,田村由香里
小林裕介,古川慎,市之濑加那,沼仓爱美,佐藤元,前野智昭,村瀬步,上田丽奈,高桥花林,河西健吾,麦人,中村悠一,石田彰,丰崎爱生
未知
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梶裕贵,村濑步
菊池正美,折笠爱,七绪春日,横山智佐,富泽美智惠,小林优子,进藤尚美,小樱悦子,森下由树子
梶裕贵,洲崎绫,小泽亚李,小野贤章,置鲇龙太郎,杉田智和,潘惠美,小清水亚美,小松未可子
已完结
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